Geleitet wird die Universität durch das Rektorat. An der HSG besteht das Rektorat aktuell aus:

• dem Rektor
• dem Prorektor Studium & Lehre
• dem Prorektor Forschung & Faculty
• der Prorektorin Aussenbeziehungen
• dem Direktor Studium & Lehre
• dem Direktor Forschung & Faculty
• dem Direktor Aussenbeziehungen
• dem Verwaltungsdirektor
• der Generalsekretärin
• der Leiter Kommunikation

Das Rektorat der Universität St.Gallen ist dem Universitätsrat, dem Senat sowie dem Senatsausschuss unterstellt. Das Rektorat unterstützt und berät den Rektor bei der Erfüllung seiner Aufgaben und ist somit keine Geschäftsleitung wie in einem privatwirtschaftlichen Umfeld. Es tagt rund fünfzehn Mal im Jahr und bereitet unter anderem die Geschäfte für den Universitätsrat, den Senat und den Senatsausschuss vor.

Der Rektor wird aus der Mitte der Ordentlichen Professorenschaft für jeweils zwei Jahre gewählt. Anders als in der Wirtschaft ist der Rektor somit kein CEO, sondern der sogenannte «primus inter pares», der Erste unter Gleichen. Er handelt im Interesse der gesamten Universität.

Der Rektor erfüllt die ihm durch das Universitätsstatut und weitere Erlasse übertragenen Aufgaben. Insbesondere hat er den Vorsitz in Senat und Senatsausschuss inne und leitet die Universität. Er beaufsichtigt die Universitätsverwaltung und vertritt die HSG nach aussen. Seit 1898 haben 21 Rektoren der Universität St.Gallen ein Gesicht gegeben.

Der Universitätsrat bestimmt die Anzahl der Prorektoren. Er hat sich auf drei festgelegt. Wie der Rektor werden die Prorektoren aus der Mitte der Professorenschaft gewählt. Sie sind für einzelne Aufgabenbereiche der HSG zuständig:

• für Studium & Lehre
• für Forschung & Faculty
• für Aussenbeziehungen

Der Rektor delegiert bestimmte Bereiche seiner ihm zugewiesenen Aufgaben an sogenannte Delegierte des Rektorats, die ihn auch beraten. Innerhalb ihrer Kompetenzen verantworten sie einzelne Themen und entwickeln diese weiter. Die Universität hat fünf Delegierte:

• für Verantwortung und Nachhaltigkeit
• für Qualitätsentwicklung
• für das Öffentliche Programm der Universität St.Gallen
• für Hochschul-Rankings und Weiterbildung
• für die Austauschprogramme